Muzeul de Istorie a Naturii din Veneţia este un alt obiectiv care îmbogăţeşte uriaşul patrimoniu turistic de pe Marele Canal al oraşului Veneţia. Muzeul este situat în aşa-numita Fondaco dei Turchi, un edificiu istoric ce datează din secolul al XIII-lea. Clădirea găzduieşte muzeul pomenit încă din 1923, moment în care colecţiile sale specifice au ocupat spaţiul de expoziţie anterior alocat patrimoniului Muzeului Correr. MUVE este entitatea responsabilă de administrarea Muzeului de Istorie a Naturii din Veneţia, ceea ce înseamnă că, printre altele, cei ce deţin un Museum Pass se pot bucura de reduceri consistente în ceea ce priveşte preţul de intrare.
O parte a specimenelor botanice şi zoologice, precum şi diverse exponate entomologice, fosile şi alte piese muzeale cu valoare etnografică au aparţinut Muzeului Correr, însă acum ţin de patrimoniul Muzeului de Istorie a Naturii. Misiunea acestei instituţii culturale este de a forma o imagine despre evoluţia vieţii în Laguna Veneţiană în toată complexitatea sa prin intermediul tuturor acestor colecţii care însumează circa două milioane de exponate. Astfel, unele dintre punctele de interes se referă la un schelet integral de dinozaur, la o splendidă colecţie de fluturi şi la acvariul (numit Acvariul Tegnue) situat la parterul clădirii. În plus, parterul mai găzduieşte şi o bibliotecă ce cuprinde aproximativ 40000 de volume.
De asemenea, coordonata educaţională a muzeului merită şi ea atenţie, precum şi caracterul interactiv şi familial al activităţilor organizate sub patronajul muzeului.